An Anatomically-Realistic Simulation Framework for Ultrasound Localization Microscopy

Hatim Belgharbi

Mémoire de maîtrise (2021)

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Résumé

En imagerie vasculaire in-vivo, on tente d'élucider un réseau vasculaire très complexe mais a priori inconnu. Des cartographies impressionnantes de la vascularisation tissulaire sont obtenues à l'aide de la microscopie de localisation par ultrasons (ULM) en suivant des microbulles (MB) à travers des milliers, voire des centaines de milliers d'images. En revanche, les études de validation pour les systèmes d'imagerie n'ont été validés que sur des fantômes composés de tubes ou de microcanaux qui ne reflètent pas la complexité de la vascularisation tissulaire ont été réalisées dans des conditions in-vitro ou in-vivo où les positions de MBs sont inconnues. Des fantômes réalistes réalisés en simulation sont essentiels pour valider la précision de la cartographie vasculaire et optimiser les paramètres, car les positions de MBs de références sont disponibles pour quantifier l'erreur de localisation. Établir la concentration en MBs optimale est un représente un défi, car elle peut être augmentée pour réduire le temps nécessaire pour peupler le réseau vasculaire, mais elle doit rester suffisamment faible pour éviter les interactions indésirables entre les microbulles, ce qui causerait un flou dans l'image résultante. Sans image ou réseau vasculaire de référence, il est très difficile d'évaluer la précision d'un système d'imagerie dans des environnements in-vivo. Par conséquent, un cadre de simulation anatomiquement et hémodynamiquement réaliste a été développé utilisant des données de cerveau de souris in-vivo acquises par microscopie à deux photons. Ce cadre permet de tester en simulation divers paramètres d'acquisition tout en ayant accès à une vérité terrain hautement résolue pour l'évaluation de la performance de la cartographie vasculaire. A partir d'un modèle en graphe, un simulateur de trajectoires de particules a été conçu pour reproduire un flux de microbulles similaire à des données in-vivo. Le simulateur permet d'obtenir des positions de MBs de référence qui peuvent ensuite être utilisées pour simuler des signaux et des images ultrasonores et sur lesquelles des métriques peuvent être calculées pour évaluer la précision de la cartographie vasculaire. A titre d'exemple, le temps d'acquisition a été calculé en fonction de diverses fréquences de transmission de sondes et de diverses concentrations de MBs. Un lien entre la concentration maximale de microbulles et le volume de la réponse impulsionnelle a été établi, où la concentration optimale de microbulles peut être calculée pour obtenir la meilleure reconstruction vasculaire d'un système d'imagerie. Le cadre développé peut donc être utilisé pour des études paramétriques pour la validation d'algorithmes de formation d'images ULM.

Programme:
Génie biomédical
Directeurs ou directrices:
Adresse URL de PolyPublie:
Université/École:
Polytechnique Montréal
OAI:
oai:publications.polymtl.ca:9734
ORCID
Date du dépôt:
27 avr. 2022 08:44
Dernière modification:
14 oct. 2026 10:53
Citer en APA 7:
Belgharbi, H. (2021). An Anatomically-Realistic Simulation Framework for Ultrasound Localization Microscopy [Mémoire de maîtrise, Polytechnique Montréal]. PolyPublie. https://publications.polymtl.ca/9734/

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