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Boudreau, M., Karakuzu, A., Boré, A., Pinsard, B., Zelenkovski, K., Alonso Ortiz, E., Boyle, J., Bellec, L., & Cohen-Adad, J. (2024). Longitudinal reproducibility of brain and spinal cord quantitative MRI biomarkers. Imaging Neuroscience. Lien externe
Boudreau, M., Karakuzu, A., Cohen-Adad, J., Bozkurt, E., Carr, M., Castellaro, M., Concha, L., Doneva, M., Dual, S. A., Ensworth, A., Foias, A., Fortier, V., Gabr, R. E., Gilbert, G., Glide-Hurst, C. K., Grech-Sollars, M., Hu, S., Jalnefjord, O., Jovicich, J., ... Stikov, N. (2024). Paper is not enough: Crowdsourcing the T₁ mapping common ground via the ISMRM reproducibility challenge [Ensemble de données]. Lien externe
Boudreau, M., Karakuzu, A., Cohen-Adad, J., Bozkurt, E., Carr, M., Castellaro, M., Concha, L., Doneva, M., Dual, S. A., Ensworth, A., Foias, A., Fortier, V., Gabr, R. E., Gilbert, G., Glide-Hurst, C. K., Grech-Sollars, M., Hu, S., Jalnefjord, O., Jovicich, J., ... ISMRM Quantitative MR Study Group, T. (2024). Repeat it without me: Crowdsourcing the T1 mapping common ground via the ISMRM reproducibility challenge. Magnetic Resonance in Medicine, 30111 (13 pages). Lien externe
Boudreau, M., Karakuzu, A., Boré, A., Zelenkovski, K., Pinsard, B., Alonso Ortiz, E., Boyle, J., Bellec, P., & Cohen-Adad, J. (juin 2023). Longitudinal stability of brain and spinal cord quantitative MRI measures [Présentation]. Dans ISMRM & ISMRT annual Meeting & Exhibition, Toronto, ON, Canada. Lien externe
Boudreau, M., Karakuzu, A., Boré, A., Pinsard, B., Zelenkovski, K., Alonso-Ortiz, E., Boyle, J., Bellec, P., & Cohen-Adad, J. (2023). Longitudinal stability of brain and spinal cord quantitative MRI measures [Ensemble de données]. Lien externe
Boudreau, M., Karakuzu, A., Boré, A., Zelenkovski, K., Pinsard, B., Alonso Ortiz, E., Boyle, J., Bellec, P., & Cohen-Adad, J. (juin 2023). Longitudinal stability of brain and spinal cord structural quantitative MRI measures [Affiche]. ISMRM & ISMRT annual Meeting & Exhibition, Toronto, ON, Canada. Lien externe
Boudreau, M., Karakuzu, A., Cohen-Adad, J., Carr, M., Doneva, M., Dual, S. A., Ennis, D. B., Ensworth, A., Foias, A., Fortier, V., Gilbert, G., Grech-Sollars, M., Holloway, L., Hu, S., Jalnefjord, O., Koken, P., Kolokotronis, A., Kukran, S., Lee, N., ... Stikov, N. (juin 2023). Phantom results of the ISMRM Joint RRSG-qMRSG reproducibility challenge on T1 mapping [Communication écrite]. ISMRM & ISMRT annual Meeting & Exhibition, Toronto, ON, Canada. Lien externe
Boudreau, M., Karakuzu, A., Cohen-Adad, J., Bozkurt, E., Carr, M., Castellaro, M., Concha, L., Doneva, M., Dual, S., Ensworth, A., Foias, A., Fortier, V., Gabr, R. E., Gilbert, G., Glide-Hurst, C. K., Grech-Sollars, M., Hu, S., Jalnefjord, O., Jovicich, J., ... Stikov, N. (2023). Results of the ISMRM 2020 joint Reproducible Research & Quantitative MR study groups reproducibility challenge on phantom and human brain T₁ mapping [Ensemble de données]. Lien externe
Blostein, N., Karakuzu, A., Samson, P., Stikov, N., & Cohen-Adad, J. (juillet 2023). Vendor-neutral automated acquisition workflow for spinal cord MRI [Affiche]. OHBM 2023, Montreal, Qc, Canada. Lien externe
Badji, A., Adrián, N. C., Karakuzu, A., Duval, T., Desjardins-Crépeau, L., Parizet, M., Joubert, S., Bherer, L., Lamarre-Cliche, M., Stikov, N., Cohen-Adad, J., & Girouard, H. (2020). Arterial stiffness cut-off value and white matter integrity in the elderly. Neuroimage-Clinical, 26, 102007 (11 pages). Lien externe
Badj, A., de la Colina, A. N., Boshkovski, T., Sabra, D., Karakuzu, A., Robitaille-Grou, M.-C., Gros, C., Joubert, S., Bherer, L., Lamarre-Cliche, M., Stikov, N., Gauthier, C. J., Cohen-Adad, J., & Girouard, H. (2020). A Cross-Sectional Study on the Impact of Arterial Stiffness on the Corpus Callosum, a Key White Matter Tract Implicated in Alzheimer's Disease. Journal of Alzheimers Disease, 77(2), 591-605. Lien externe
Badji, A., Noriega de la Colina, A., Karakuzu, A., Duval, T., Desjardins-Crépeau, L., Joubert, S., Bherer, L., Lamarre-Cliche, M., Stikov, N., Girouard, H., & Cohen-Adad, J. (mai 2019). Arterial stiffness and white matter integrity in the elderly : a diffusion tensor and magnetization transfer imaging study [Affiche]. ISMRM 27th Annual Meeting & Exhibition, Montréal, Qc. Lien externe
Badji, A., de la Colina, A. N., Karakuzu, A., Duval, T., Desjardins-Crepeau, L., Joubert, S., Bherer, L., Lamarre-Cliche, M., Stikov, N., Girouard, H., & Cohen-Adad, J. (2019). Arterial stiffness and white matter integrity in the elderly: a diffusion tensor and magnetization transfer imaging study. NeuroImage, 186, 577-585. Lien externe
DuPre, E., Holdgraf, C., Karakuzu, A., Tetrel, L., Bellec, P., Stikov, N., & Poline, J.-B. (2022). Beyond advertising: New infrastructures for publishing integrated research objects. PLOS Computational Biology, 18(1), e1009651 (7 pages). Disponible
Harding, R., Bermudez, P., Bernier, A., Beauvais, M. J.S., Bellec, P., Hill, S., Karakuzu, A., Knoppers, B. M., Pavlidis, P., Poline, J.-B., Roskams, J., Stikov, N., Stone, J., Strother, S. C., & Evans, A. C. (2023). The Canadian Open Neuroscience Platform—An open science framework for the neuroscience community. PLOS Computational Biology, 19(7), e1011230 (14 pages). Disponible
Karakuzu, A., Boudreau, M., & Stikov, N. (2024). Reproducible Research Practices in Magnetic Resonance Neuroimaging: A Review Informed by Advanced Language Models. Magnetic Resonance in Medical Sciences, 0174 (16 pages). Lien externe
Karakuzu, A., Arpak, A., & Yucesoy, C. A. (2023). In-vivo along muscle fascicle strain heterogeneity is not affected by image registration parameters: Robustness testing of combined magnetic resonance-diffusion tensor imaging method. Journal of the Mechanical Behavior of Biomedical Materials, 139, 105681 (11 pages). Lien externe
Karakuzu, A. (2022). Bringing Quantitative Magnetic Resonance Imaging Under One Umbrella [Thèse de doctorat, Polytechnique Montréal]. Disponible
Karakuzu, A., Biswas, L., Cohen-Adad, J., & Stikov, N. (2022). Vendor-neutral sequences and fully transparent workflows improve inter-vendor reproducibility of quantitative MRI. Magnetic Resonance in Medicine, 88(3), 1212-1228. Lien externe
Karakuzu, A., Hollander, G., Appelhof, S., Auer, T., Boudreau, M., Feingold, F., Khan, A. R., Lazari, A., Phillips, C., Stikov, N., & Whitaker, K. (août 2020). A joint-community effort to standardize quantitative MRI data : update from the BIDS extension proposal [Présentation]. Dans 2020 Joint annual meeting ISMRM & ISMRT. Lien externe
Karakuzu, A., Boudreau, M., Duval, T., Boshkovski, T., Leppert, I., Cabana, J.-F., Gagnon, I., Beliveau, P., Pike, G. B., Cohen-Adad, J., & Stikov, N. (2020). qMRLab: Quantitative MRI analysis, under one umbrella. Journal of Open Source Software, 5(53), 2343 (4 pages). Disponible
Karakuzu, A., Boudreau, M., Cohen-Adad, J., & Stikov, N. (août 2020). Thinking outside the black box: A fully transparent T1 mapping pipeline [Affiche]. 2020 Joint annual meeting ISMRM & ISMRT. Lien externe
Karakuzu, A. (2020). VFA T1 mapping | RTHawk (open) vs Siemens (commercial) [Ensemble de données]. Lien externe
Mancini, M., Karakuzu, A., Cohen-Adad, J., Cercignani, M., Nichols, T., & Stikov, N. (2022). An interactive meta-analysis of MRI biomarkers of myelin [Ensemble de données]. Lien externe
Maier, O., Baete, S. H., Fyrdahl, A., Hammernik, K., Harrevelt, S., Kasper, L., Karakuzu, A., Loecher, M., Patzig, F., Tian, Y., Wang, K., Gallichan, D., Uecker, M., & Knoll, F. (2021). CG-SENSE revisited: Results from the first ISMRM reproducibility challenge. Magnetic Resonance in Medicine, 85(4), 1821-1839. Lien externe
Mancini, M., Karakuzu, A., Cohen-Adad, J., Cercignani, M., Nichols, T. E., & Stikov, N. (2020). An interactive meta-analysis of MRI biomarkers of myelin. Elife, 9, e61523 (23 pages). Lien externe
Maier, O., Baete, S. H., Fyrdahl, A., Hammernik, K., Harrevelt, S., Kasper, L., Karakuzu, A., Loecher, M., Patzig, F., Tian, Y., Wang, K., Gallichan, D., Uecker, M., & Knoll, F. (2020). ISMRM Reproducible Research Study Group: Data for the paper "CG-SENSE revisited: Results from the first ISMRM reproducibility challenge" [Ensemble de données]. Lien externe
Niso, G., Botvinik-Nezer, R., Appelhoff, S., De la Vega, A., Esteban, O., Etzel, J. A., Finc, K., Ganz, M., Gau, R., Halchenko, Y. O., Herholz, P., Karakuzu, A., Keator, D. B., Markiewicz, C. J., Maumet, C., Pernet, C. R., Pestilli, F., Queder, N., Schmitt, T., ... Rieger, J. W. (2022). Open and reproducible neuroimaging: From study inception to publication. NeuroImage, 263, 119623 (19 pages). Disponible
Poldrack, R. A., Markiewicz, C. J., Appelhoff, S., Ashar, Y. K., Auer, T., Baillet, S., Bansal, S., Beltrachini, L., Benar, C. G., Bertazzoli, G., Bhogawar, S., Blair, R. W., Bortoletto, M., Boudreau, M., Brooks, T. L., Calhoun, V. D., Castelli, F. M., Clement, P., Cohen, A. L., ... Gorgolewski, K. J. (2024). The past, present, and future of the brain imaging data structure (BIDS). Imaging Neuroscience, 2, 00103 (19 pages). Lien externe
