High-dimensional bayesian clustering with variable selection: The R package bclust

Vahid Partovi Nia, Anthony C. Davison

Article de revue (2012)

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Résumé

The R package bclust is useful for clustering high-dimensional continuous data. The package uses a parametric spike-and-slab Bayesian model to downweight the effect of noise variables and to quantify the importance of each variable in agglomerative clustering. We take advantage of the existence of closed-form marginal distributions to estimate the model hyper-parameters using empirical Bayes, thereby yielding a fully automatic method. We discuss computational problems arising in implementation of the procedure and illustrate the usefulness of the package through examples.

Mots clés

Organismes subventionnaires:
Swiss SNF Fellowship, NSERC Discovery Grant, VAHSR&D Grant
Numéro de subvention:
PBELP2-125531S, 341315/200, IIR 07-229
Adresse URL de PolyPublie:
Titre de la revue :
Journal of Statistical Software ( vol. 47 , no 5 )
Maison d'édition:
Foundation for Open Access Statistics
OAI:
oai:publications.polymtl.ca:5058
ORCID
Date du dépôt:
18 nov. 2022 13:52
Dernière modification:
14 oct. 2026 10:44
Citer en APA 7:
Partovi Nia, V., & Davison, A. C. (2012). High-dimensional bayesian clustering with variable selection: The R package bclust. Journal of Statistical Software, 47(5), 22 pages. https://doi.org/10.18637/jss.v047.i05

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