Évaluation des performances des laboratoires COVID-19 du Népal par simulation à événements discrets

La pandémie de COVID-19 qui s’est propagée à partir du 31 décembre 2019 a pris de court les systèmes de santé du monde entier. Les pays ont dû mettre en place rapidement plusieurs mesures pour contrer la propagation, soigner les personnes atteintes et faire un suivi de l’état de la pandémie au sein de la population. Le dépistage a rapidement été mis en place pour permettre de cibler les foyers d’éclosion et limiter la propagation. Lorsque la pandémie a commencé, le système de santé au Népal, comme tant d’autres, était en manque important d’équipements et de personnes qualifiées. Un projet a émergé avec le South East Asia Regional Office of the World Health Organization (WHO/SEARO). Trois équipes ont travaillé en étroite collaboration pour coordonner la chaîne de dépistage de COVID-19 au Népal (l’accessibilité des centres de prélèvements, le transport des échantillons et l’organisation des laboratoires). Le présent projet se concentre sur la partie organisation des laboratoires. À cette fin, nous proposons l'application d'approches bien établies avec les modèles de simulation à évènements discrets (DES) afin de faire l'analyse des performances des laboratoires au Népal. Avec l'aide des parties prenantes du projet (WHO, Ministry of Health and Population Nepal et travailleurs des laboratoires), plusieurs scénarios ont été testés afin d'évaluer la capacité et les performances du laboratoire. Entre autres, nous avons testé différents niveaux de demande (en nombre d’échantillons) et différentes organisations du personnel, identifié les goulots d'étranglement dans le traitement des échantillons, estimé l'impact du problème d'accès aux réactifs sur le fonctionnement des laboratoires ainsi que l'impact de l'accès à des équipements automatisés. Plus généralement, nous avons exploré les facteurs clés qui déterminent la performance et la résilience du système de test. Nous avons utilisé la cible du nombre de résultats communiqués dans une période de 48h pour évaluer la performance du système. Les résultats obtenus ont permis de déterminer que la performance des laboratoires était très sensible aux horaires de travail du personnel des laboratoires. Le principal goulot d’étranglement identifié est donc l’organisation du personnel plutôt qu’une étape précise du processus. De façon générale, pour diminuer de façon significative le temps requis pour traiter les échantillons, l’introduction d’un système d’automatisation tel qu’une machine pour transférer les échantillons du tube de prélèvement est efficace. L’ajout d’un système à code-barre s’est avéré également intéressant, mais uniquement dans les situations où le nombre d’échantillons devenait plus important pour les laboratoires. Les scénarios de pénurie de réactifs spécifiques à la machine d’extraction ont démontré que les laboratoires avaient la capacité de s'adapter en faisant les manipulations par les techniciens. Lorsque des réactifs pour faire l'extraction manuellement n'étaient pas accessibles, les laboratoires pouvaient absorber jusqu’à 24h sans accès aux réactifs. C’est au-delà de deux jours ou plus que le fonctionnement des laboratoires se retrouvait perturbé.